Израильские самолеты атаковали авиабазы на египетской территории, проникнув в Египет с запада и севера со стороны Средиземного моря, в то время как египетские радары в основном просматривали территорию к северо-востоку и востоку, предполагая, что израильские самолеты могут атаковать только со стороны израильской границы. Кроме того, израильские самолеты летели на предельно малой высоте, недоступной для египетских радаров, и соблюдали полное радиомолчание.
То, что израильские самолеты атаковали с неожиданного северо-западного направления, позже дало президенту Насеру основание для обвинений ВВС западных стран в помощи Израилю в ходе войны.
В частности, он заявил, что в нападении участвовали ВВС Шестого флота США.
Израильская атака была очень точно скоординирована. Израильские самолеты, разных типов и вылетевшие с разных баз, атаковали египетские аэродромы, находящиеся в различных частях Египта, практически одновременно.
В день израильского нападения египетские ПВО получили приказ не стрелять по пролетающим военным самолетам, поскольку существовало опасение, что может быть сбит самолет с египетским военным командованием, отправившимся в это утро для инспекции позиций на Синае.
Этот приказ усилил замешательство египтян во время израильской атаки.
Примерно в 11 часов утра Израиль стал подвергаться налетам со стороны ВВС Сирии и Иордании. В 11:50 по объектам на территории Израиля нанесли удар 16 иорданских самолетов, в результате чего был убит один и ранено семь мирных жителей, уничтожен 1 самолет на земле.
В результате ответного израильского авиаудара по базам ВВС этих стран в 12:45 были уничтожены все ВВС Иордании — 28 самолетов и около половины ВВС Сирии — 53 самолета, а также 10 иракских самолетов. В Ливане в ходе авианалета был уничтожен пассажирский самолет DC-7 иорданских авиалиний.
Разгром ВВС противника в первый же день войны позволил израильским ВВС добиться почти полного господства в воздухе. Практически не встречающие сопротивления бомбардировки арабских колонн и позиций израильскими ВВС, в том числе с применением напалма, были важнейшим фактором деморализации и коллапса египетской, сирийской и иорданской армий.
Утром 5 июня, в день начала войны, пресс-служба армии Израиля заявила, что с ранних часов утра израильская армия вступила в бой с египетской армией, которая начала «продвижение в сторону Израиля».
6 июня. Второй день. Пара тяжелых бомбардировщиков Ту-16 ВВС Ирака нанесла бомбовые удары в глубине израильской обороны.
